Her er nogle vigtige aspekter af Alice's interne kamp:
* Find sin egen identitet: Alice bliver fanget mellem samfundets forventninger og hendes egne ønsker. Hun føler sig begrænset af sit liv i det viktorianske England og længes efter noget mere.
* Håndtering af sorg og tab: Filmen udforsker sorgen Alice bærer fra sin fars død. Denne interne kamp er ikke eksplicit angivet, men det tilbagevendende billede af hendes fars ur, den hvide kaninens besættelse af tiden og Alice's oprindelige modstand mod forandring er antydninger til hendes uopløste sorg.
* Konfrontering af hendes frygt: Alice er oprindeligt bange for Wonderland og hendes eget potentiale. Hun tvivler på sine evner og kæmper for at tro på sig selv.
* at lære at stole på hendes intuition: Alice får konstant at vide, hvad de skal gøre, og hvordan man skal opføre sig. Filmen understreger hendes rejse med at lære at stole på hendes egen intuition og træffe sine egne valg.
I sidste ende drejer Alice's interne konflikt sig omkring hendes kamp for at bryde fri fra samfundsmæssige forventninger, konfrontere hendes frygt og omfavne sin egen unikke identitet. Dette er et almindeligt tema i mange historier fra kommende alder, og det resonerer stærkt med publikum i alle aldre.