Forskningsmetoder bruge både etnografi og musikalsk transskription og analyse og inkludere feltarbejde og interviews med informanter. Nogle etnomusikologer udfører også den musik, de studerer, mens andre fokuserer mere på analyse og fortolkning.
Feltarbejde giver etnomusikologer mulighed for at fordybe sig i musikken og kulturen hos de mennesker, de studerer, hvilket giver dem mulighed for at få en dyb forståelse af den rolle, musikken spiller i deres liv.
Fordi kulturer og musikalske praksisser konstant ændrer sig, indsamler etnomusikologer ofte lyd- og videooptagelser, transskriberer og analyserer musikalske optrædener, skaber musikinstrumenter, komponerer og arrangerer musik og dokumenterer resultaterne af deres forskning i bøger, artikler og andre publikationer.