I stedet har hver episode typisk en anden mordssag, der ofte involverer en unik og overbevisende morder. Der er tilbagevendende karakterer, der fungerer som skurke i flere episoder, men de er ikke hovedfokus i serien.
Nogle af de mest mindeværdige tilbagevendende skurke inkluderer:
* Gravedigger: En seriemorder, der begraver sine ofre i detaljerede, ritualistiske grave.
* dukketeeren: En seriemorder, der manipulerer sine ofre til at dræbe sig selv.
* Gormogon: En seriemorder, der efterlader kryptiske meddelelser og gåder for holdet at løse.
Fokus for showet er primært på forholdet mellem Dr. Temperance Brennan og Special Agent Seeley Booth og processen med at løse mysterierne, der er præsenteret i hver episode.