1. Alice Awakening :Hotaru er en Special Ability-bruger, også kendt som en Alice, med den sjældne Sensory Link Alice. Hendes Alice giver hende mulighed for at opdage og forbinde sig med andres sind. Hun vækker sin Alice i en ung alder.
2. Fængsling og fængsling :På grund af hendes Alices potentielle fare og uforudsigelighed, bliver Hotaru taget til fange af en gruppe kaldet "Zero" som et lille barn. Hun er fængslet i et særligt forskningsanlæg, hvor der udføres eksperimenter på hendes Alice.
3. Rescue by Natsume :Hotaru bliver til sidst reddet af Natsume Hyuga, en elev fra Alice Academy's Special Ability Team (SAT), som anerkender hendes potentiale og vil hjælpe hende med at kontrollere sin Alice.
4. Tilmelding til Alice Academy :Hotaru melder sig med succes ind på Alice Academy, hvor hun slutter sig til klasse B. På trods af sin svære fortid begynder hun at få venner og finde et sted, hvor hun hører til.
5. Udforske hendes Alices potentiale :Efterhånden som Hotarus tid på akademiet skrider frem, får hun gradvist bedre kontrol over sin Sensory Link Alice. Hun opdager, at hun ikke kun kan opdage tanker, men også manipulere dem til en vis grad.
6. Håndtering af indre konflikter :Hotaru kæmper med sine indre dæmoner og følelser af isolation på grund af sin stærke og unikke Alice. Hun gennemgår personlig vækst og selvopdagelse, mens hun lærer at acceptere og omfavne sig selv for den hun er.
7. Kærlighedsinteresse :Hotaru udvikler romantiske følelser for Yuuto Kiba, et andet SAT-medlem. Deres forhold står over for udfordringer og komplikationer på grund af deres respektive Alice-evner og involvering i forskellige missioner og konflikter.
8. Bidrag til SAT :Efterhånden som Hotaru bliver mere dygtig med sin Sensory Link Alice, spiller hun en stadig vigtigere rolle i SAT-missioner og -undersøgelser. Hendes evner viser sig at være uvurderlige til at indsamle intelligens og forstå modstandernes intentioner.
9. Involvering i Key Story Arcs :Hotaru er direkte involveret i flere betydningsfulde historiebuer gennem serien. Disse buer kredser ofte om magtfulde Alice-evner, hemmelige organisationer og trusler mod Alice Academy og verden som helhed.
10. Skæbne og afslutning :Hotarus ultimative skæbne afhænger af den specifikke version eller vej af Alice Academy-historien. I nogle afslutninger overvinder hun med succes sine udfordringer, finder lykke med sine venner og kære og fortsætter med at vokse som Alice-bruger.