Murder on the Orient Express dykker ned i temaet identitet og dets kompleksitet. Romanen præsenterer flere karakterer med forskellige baggrunde, kulturer og dagsordener, der hver skjuler en skjult identitet eller bærer hemmeligheder. Poirot, detektiven, må se ud over overfladen for at fastslå passagerernes sande karakterer og motiver.
Temaet retfærdighed spiller også en væsentlig rolle i historien. Poirot søger ikke kun at opklare forbrydelsen, men også at sikre, at retfærdigheden bliver udtjent. Passagererne står over for et etisk dilemma, da de går sammen for at afgøre morderens skæbne. De skal afgøre, om de skal følge strenge juridiske procedurer eller tage sagen i egen hånd for at opnå en følelse af retfærdighed, som de mener er nødvendig.
Romanen rejser spændende spørgsmål om kompleksiteten af menneskelig identitet, moralens tvetydighed og søgen efter sandhed og retfærdighed.