- Spis, drik og vær sund:Harvard Medical School Guide to Healthful Eating (2001)
- Nutritional Epidemiology, 3. udgave (2013) (co-redigeret med Meir Stampfer)
- Willett's Nutritional Epidemiology, anden udgave (2018) (redigeret af Willett)
- The Salt Sugar Fat Fix:How the Food Giants Hooked Us (2020) (medforfatter med Marion Nestle)
Ud over disse bøger har Walter Willett publiceret videnskabelige artikler, anmeldelser og politiske anbefalinger i forskellige medicinske og ernæringsmæssige tidsskrifter.