Klassiske skurke:
* Romulanerne: Et hemmelighedsfuldt og militaristisk løb med en dybtliggende mistillid til forbundet. Deres signaturvåben, "disruptoren", var en konstant trussel.
* Klingonerne: Hårde krigere med en brutal kultur, Klingonerne var ofte i modstrid med Føderationen. Deres fokus på ære og styrke førte ofte til konflikter.
* The Gorn: En krybdyrart kendt for deres styrke og aggression. Deres rivalisering med Federationen var et stort tilbagevendende tema.
* Tholianerne: En avanceret art med en streng overholdelse af logik og orden. De var kendt for deres sofistikerede teknologi og hensynsløse forsvar af deres territorium.
* Orion-piraterne: En berygtet gruppe kriminelle, der forgreb sig på intetanende skibe. De var kendt for deres hensynsløshed og deres brug af avanceret teknologi.
* Tribbles: Tilsyneladende harmløse udgjorde disse lodne væsner en uventet trussel mod føderationen på grund af deres hurtige reproduktionshastighed og evne til at forårsage betydelig økologisk skade.
Andre bemærkelsesværdige skurke:
* Khan Noonien Singh: Et gensplejset supermenneske, der forsøgte at erobre galaksen. Han var en af de mest mindeværdige skurke i serien, og optrådte i det klassiske afsnit "Space Seed".
* Organisationerne: Et fredeligt og magtfuldt løb med evnen til at manipulere virkeligheden. Deres handlinger i episoden "Errand of Mercy" førte til etableringen af den neutrale zone mellem føderationen og romulanerne.
* "Nomad"-sonden: Et selvbevidst computerprogram med en skæv sans for logik. Det udgjorde en trussel mod Føderationen ved at forsøge at eliminere alle ikke-perfekte væsener.
Tilbagevendende temaer:
* Farerne ved ukontrolleret kraft og teknologi: Mange skurke var drevet af ambitioner, grådighed eller et ønske om at kontrollere andre.
* Vigtigheden af diplomati og forståelse: Mange konflikter i serien blev løst gennem diplomati og samarbejde.
* Den iboende konflikt mellem logik og følelser: Mange skurke var drevet af logik eller en kold, beregnende natur, mens forbundsmandskabet ofte stolede på empati og medfølelse.
Den originale Star Trek-serie tilbød et rigt billedtæppe af skurke, der hver repræsenterede en anden facet af menneskehedens potentiale for både godt og ondt. Selvom disse antagonister kan virke forældede efter nutidens standarder, fortsætter de med at inspirere forfattere og fans med deres overbevisende historier og varige budskaber.