Gideon forlod kriminelle sind i slutningen af sæson 2. Han trak sig tilbage fra BAU efter at have oplevet ekstrem PTSD efter hans fangst og tortur af en seriemorder.
Afgangen blev forklaret i sæson 2-finalen, "The Fisher King (del II)," hvor Gideon konfronterer sit traume og beslutter, at han har brug for at prioritere sit eget velbefindende.
Han vises i senere sæsoner, men kun i gæstekster, som i episoden "The Fisher King" (sæson 5) og "Replikatoren" (sæson 8).