Ifølge bandets hjemmeside:"Navnet "Trans-Siberian Orchestra" var udtænkt af tekstforfatteren og komponisten Paul O'Neill. Paul forestillede sig bandet som et musikalsk tog, der rejste over hele verden, forener kulturer og spreder ferieglæde. Sibirisk" del af navnet hentyder til vintertemaet, da toget ville være fyldt med musikere, der opførte ferieklassikere fra hele kloden. "Trans"-delen refererer ikke kun til orkestrets internationale rejse, men også til dets evne til at overskride musikalske grænser ."
Dette er sandsynligvis den fiktive oprindelse til bandets navn, men andre kilder krediterer, at navnet er afledt af den transsibiriske jernbane, som er den længste jernbanelinje i verden. Jernbanen passerer gennem otte tidszoner og forbinder Moskva med Vladivostok. Den transsibiriske jernbane bruges ofte som et symbol på Ruslands vidstrakthed og mangfoldighed, og det er muligt, at bandets navn er en reference til dette.