Mens katakomberne ikke officielt blev skabt af kongen, blev de bygget i en tid med betydelig urbanisering i Paris. Byens kirkegårde var overfyldte, og praksis med at overføre knogler fra overfyldte kirkegårde til de forladte underjordiske stenbrud startede i 1786 under Louis XVIs styre.
Selvom Louis XVI ikke var direkte involveret i opførelsen af katakomberne, så hans regeringstid begyndelsen på den praksis, der førte til dannelsen af denne berømte underjordiske ossuary.