Der er dog nogle kompleksiteter:
* Tabte værker: Mange af hans værker er gået tabt, ødelagt eller er stadig uopdagede.
* Samarbejde: Van Eyck samarbejdede sandsynligvis med sit værksted, så nogle malerier, der blev tilskrevet ham, kunne være blevet udført af assistenter.
* Tilskrivninger: Nogle værker diskuteres blandt kunsthistorikere om, hvorvidt de udelukkende er malet af Van Eyck eller delvist af hans værksted.
Så selvom vi har en rimelig idé om hans overlevende arbejde, forbliver det sande antal malerier, han skabte, et mysterium.