2. Find en hemmelig baseplacering. Der er mange forskellige hemmelige baseplaceringer i hele Sinnoh. Nogle af de mest populære steder inkluderer:
* Den lille ø i rute 218
* Hulen nær indgangen til Lost Tower i rute 213
* Huset i Pastoria City, der er under opførelse
3. Brug Secret Base Kit. Når du har fundet en hemmelig baseplacering, skal du bruge Secret Base Kit til at oprette din base. Du kan vælge hvilken type base du vil lave, og du kan også dekorere den med møbler og andre ting.
4. Rekrutér teammedlemmer. Du kan rekruttere andre spillere til at deltage i dit hemmelige basehold. For at gøre dette skal du tale med den person, du vil rekruttere, og vælge muligheden "Rekrutter".
5. Kæmp mod andre hold. Du kan kæmpe mod andre holds hemmelige baser ved at tale med personen ved indgangen til basen og vælge "Kamp". Hemmelige basekampe er 2-mod-2-kampe, og vinderen er det første hold, der slår begge deres modstanderes Pokemon ud.
6. Optjen point og belønninger. Du kan optjene point ved at vinde hemmelige basekampe og ved at gennemføre hemmelige basemissioner. Du kan bruge point til at købe varer fra Secret Base Shop, og du kan også bruge dem til at opgradere din hemmelige base.