Sådan fungerer det:
1. Bossduellen :Du kæmper mod "Final Boss" i "Den sidste historie" niveau.
2. Forvandlingen :Efter at have besejret chefen forvandler Sonic sig til sin "Super"-form.
3. Den sidste kamp :Den "endelige chef" dukker op igen i en ny form, og du kæmper mod den igen på samme niveau .
Så du går ikke videre til et separat niveau efter den indledende bosskamp. Du fortsætter simpelthen kampen mod "Final Boss" i sin nye, mere kraftfulde form efter Sonic transformerer.