Tekniske problemer:
* Dårligt optimeret: Spillet var fyldt med fald i billedhastigheden, glitches og opbremsninger, især på PlayStation 3. Dette fik selv grundlæggende gameplay til at føles klodset og frustrerende.
* Niveaudesign: Mange niveauer var gentagne, uinspirerede og forvirrende. Kameravinklerne forhindrede ofte gameplayet, hvilket gjorde det svært at navigere.
* Bug: Sonic 06 var plaget af adskillige fejl, lige fra fjender, der fasede gennem vægge til karaktermodeller, der klippede gennem miljøet. Dette skabte en utrolig ustabil og ødelagt oplevelse.
Spilleproblemer:
* Kontroller, der ikke reagerer: Sonic, Shadow og Silver føltes alle akavede at kontrollere, med inkonsekvent fysik og glatte bevægelser.
* Niveaudesign: Niveauerne manglede ofte variation, med gentagne miljøer og uinspirerede gimmicks. Dette førte til en monoton og uengagerende oplevelse.
* Svære bosskampe: Mange bosskampe var frustrerende uretfærdige med uklare angrebsmønstre og billige taktikker.
Historieproblemer:
* Forvirrende og indviklet: Historien var et indviklet rod med forvirrende plotpunkter, inkonsekvente karaktermotivationer og en meningsløs slutning.
* Svag karakterudvikling: Karaktererne, især Shadow og Silver, var dårligt skrevet og manglede dybde. Deres interaktioner føltes tvunget og manglede følelsesmæssig vægt.
* Tvungen romantik: Introduktionen af Elise, en menneskelig prinsesse, var en rystende tilføjelse til Sonic-universet og føltes tvunget og unødvendig.
Andre faktorer:
* Forhastet udvikling: Spillet blev hastet for at overholde en feriedeadline, hvilket resulterede i et meget ufærdigt produkt.
* Dårlig markedsføring: Sonic 06 var stærkt markedsført før udgivelsen, hvilket i sidste ende førte til skuffelse blandt fans på grund af spillets dårlige kvalitet.
Samlet set formåede Sonic 06 ikke at indfri sit løfte om en frisk og innovativ Sonic-oplevelse. Dets tekniske problemer, gameplay-fejl og indviklede historie skabte et frustrerende og skuffende spil, der i vid udstrækning betragtes som et lavpunkt for franchisen.
Det er vigtigt at bemærke, at nogle fans kan have en anden mening om spillet og måske finde nydelse i dets fejl. Imidlertid er dens overordnede modtagelse og kritiske anmeldelser overvældende negative.