Her er en opdeling:
* Anklagen: Percy er fejlagtigt anklaget for at stjæle Zeus' mesterlyn, et kraftfuldt våben. Denne anklage bringer ham i enorm fare, da Zeus er rasende og klar til at udløse sin vrede.
* Søgen: Percy skal sammen med sine venner Annabeth og Grover påbegynde en søgen efter at finde den rigtige tyv og rense hans navn. Denne søgen tager dem på tværs af landet og står over for forskellige farlige væsner og monstre fra græsk mytologi.
* Udfordringerne: Percy står over for mange forhindringer, herunder:
* Hades' Underverden: Han skal ned i underverdenen, kæmpe mod de døde og guden Hades selv.
* Furierne: Han skal unddrage sig de ubarmhjertige Furies, skabninger, der forfølger dem, der begår forbrydelser.
* Minotauren: Han bekæmper den frygtindgydende Minotaurus, et væsen med en menneskekrop og et tyrehoved.
* Opløsningen: Percy opdager den virkelige skyldige, en titan ved navn Kronos, som planlægger at vælte de olympiske guder. Han indser også, at han er søn af Poseidon, havets gud, og hans kræfter er en vigtig faktor i at forhindre krigen.
* Klimakset: Percy står i sidste ende over for den ultimative test ved at konfrontere Kronos og genvinder i sidste ende Zeus' lyn og returnerer det til sin retmæssige ejer.
I bund og grund er prøvelsen i "The Lightning Thief" en test af Percys mod, loyalitet og styrke, hvilket får ham til at opdage sin sande identitet og den magt, han besidder.