* Kryptonit: Dette radioaktive mineral fra Supermans hjemplanet Krypton er hans mest berømte svaghed. Eksponering for kryptonit svækker Superman, hvilket gør ham syg og modtagelig for skader. Forskellige typer kryptonit har forskellige virkninger, nogle er mere dødelige end andre.
* Magi: Selvom Superman er utrolig stærk, har han vist sårbarhed over for magi. Karakterer med magiske evner har været i stand til at såre Superman, selv når han ellers er uovervindelig.
* Rød solstråling: Supermans kræfter bliver drevet af Jordens gule sol. Udsættelse for rød solstråling, ligesom hans hjemplanet Krypton, svækker ham og til sidst dræner hans kræfter fuldstændigt.
* Visse psykologisk baserede angreb: Selvom Superman er utrolig robust, kan han være sårbar over for psykiske angreb. Nogle skurke har været i stand til at udnytte hans menneskelige følelser og moral, hvilket har fået ham til at stille spørgsmålstegn ved sine handlinger og et øjeblik svække ham.
Det er vigtigt at huske, at Supermans sårbarheder er blevet udforsket og portrætteret forskelligt gennem årene, afhængigt af forfatteren og historien, der bliver fortalt.