* Tone: Gravity Falls er en mere lethjertet og komisk serie, mens Mystery Incorporated er mere mørk og seriøs. Gravity Falls byder ofte på slapstick-komedie og humor baseret på ordspil, mens Mystery Incorporated er mere spændingsfyldt og er mere afhængig af humor med horror-tema.
* Tegn: Karaktererne i Gravity Falls er mere excentriske og skæve, mens karaktererne i Mystery Incorporated er mere realistiske og relaterbare. Gravity Falls-karaktererne er mere tilbøjelige til at komme i skøre situationer og have mærkelige evner, mens Mystery Incorporated-karaktererne er mere tilbøjelige til at blive involveret i seriøse undersøgelser og står over for reel fare.
* Indstilling: Gravity Falls foregår i en lille, isoleret by i Oregon, mens Mystery Incorporated foregår i den fiktive by Crystal Cove, Californien. Gravity Falls er en mere overnaturlig indstilling, med mærkelige væsner og begivenheder, der forekommer regelmæssigt, mens Crystal Cove er en mere normal indstilling, hvor mysterierne typisk er forårsaget af menneskelige kriminelle.
* Format: Gravity Falls er en serialiseret serie, hvor hvert afsnit bygger på de foregående afsnit og fører til en større overordnet historie. Mystery Incorporated er mere episodisk, hvor hver episode er en selvstændig historie.
Samlet set er Gravity Falls og Scooby-Doo Mystery Incorporated begge fremragende animerede mysteriekomedieserier, men de har forskellige styrker og svagheder. Gravity Falls er en mere lethjertet og komisk serie med mere excentriske karakterer, mens Mystery Incorporated er en mere mørk og seriøs serie med mere realistiske karakterer.