Større roller:
* Doogie Howser, M.D. (1989-1993): Hans udbrudsrolle som teenagevidunderlæge.
* How I Met Your Mother (2005-2014): Spillede den charmerende og elskelige Barney Stinson.
* En række uheldige hændelser (2017-2019): Portrætterede den skumle grev Olaf i denne mørke komedie-atisering.
* Det er en synd (2021): Spillede Henry, en ven af hovedpersonerne, i dette roste drama om AIDS-krisen i London.
* Ukoblet (2022-nutid): Stjerner i øjeblikket som Michael Lawson, en nyligt skilt mand, der navigerer på datingscenen i New York City.
Tilbagevendende roller:
* Starship Troopers (1997): Optrådte som en soldat ved navn menig Carl Jenkins.
* The Simpsons (2000): Medvirkede som en syngende tjener i afsnittet "The Mansion Family".
* Amerikansk far! (2009-nu): Udtaler Steve Smiths karakter.
* The Big Bang Theory (2010-2019): Havde en tilbagevendende rolle som Barney the Stinson-karakter.
Gæsteoptrædener:
* The Muppets (1976-1981): Optrådte i flere afsnit.
* Dr. Quinn, Medicine Woman (1993): Gæstede som ung læge.
* The West Wing (2000-2006): Spillede en gæsterolle i et afsnit.
* Tabt (2004-2010): Havde en mindeværdig gæsteoptræden som en mystisk karakter.
* Glee (2009-2015): Medvirkede i flere afsnit som den morsomme Bryan Ryan.
Dette er ikke en udtømmende liste, men den omfatter de mest betydningsfulde tv-serier, Neil Patrick Harris har været involveret i. Han er kendt for sin alsidighed og komiske timing og har fortsat påtaget sig forskellige roller på tværs af en række genrer.