Argumenter for kanonicitet:
* Oprettet af Gene Roddenberry: TAS blev direkte overvåget og godkendt af Gene Roddenberry, skaberen af Star Trek, og havde til formål at forblive tro mod ånden i den originale serie.
* Officiel kontinuitet: I mange år blev TAS betragtet som kanon af Paramount, og forfattere på efterfølgende serier refererede ofte til eller byggede på elementer fra den animerede serie.
* Historieelementer: TAS introducerede mange elementer, der senere blev adopteret i live-action-serien, inklusive Tribbles, planeten Vulcan og visse karakterer som Maquis.
Argumenter mod kanonicitet:
* Anden tone og stil: Animationsstilen og historiefortællingen i TAS adskilte sig væsentligt fra live-action-showene, nogle gange hældende mod en mere finurlig og komisk tone.
* Modsigelser: Nogle elementer i TAS modsiger senere kanon, såsom Spocks følelsesmæssige kontrol er mere begrænset i den animerede serie.
* Uoverensstemmelser: Der var uoverensstemmelser i teknologi og viden mellem TAS og efterfølgende live-action-shows.
Den aktuelle status:
Mens TAS tidligere er blevet behandlet som kanon, er det i stigende grad blevet accepteret af Star Trek-fans og endda forfattere, at TAS ikke er strengt kanon . Dette skyldes hovedsageligt uoverensstemmelserne og udviklingen af Star Trek-universet gennem senere serier og film.
Sådan ses det ofte nu:
* Løs Canon: TAS kan betragtes som en del af Star Trek "universet" og kan nydes som et komplementært stykke af den overordnede fortælling.
* Inspiration: Mange elementer i TAS betragtes som inspirerende og påvirker efterfølgende kanon, men ikke nødvendigvis direkte kanoniske.
I sidste ende er beslutningen om, hvorvidt TAS-kanon skal overvejes, op til den enkelte seer. Det er en fantastisk serie i sig selv og tilbyder et unikt bud på Star Trek-verdenen.