Her er nogle af hans bemærkelsesværdige filmprojekter:
* Balladen om den triste café (1991):En filmatisering af Carson McCullers' roman, instrueret af Allen.
* Møllens ønske (1992):En dokumentar om Allens arbejde, instrueret af Allen.
* Den lille bys terror (1998):En musikalsk film af Allen.
* Det menneskelige instrument (2002):En film om Allens kreative proces, instrueret af Allen.
* En kærlighedssang til Bobby Bloom (2014):En musikalsk film af Allen med Allen som hovedpersonen.
* Den hovedløse rytter (2015):En film af Allen, tilpasset fra Washington Irving-historien.
* The Last Days of the Texas Republic (2019):En eksperimentel film af Allen.
Terry Allen er en meget anerkendt kunstner, der har produceret et stort værk, men hans primære fokus har været på musik og billedkunst. Han har kun instrueret film, ikke medvirket i dem.