Geiger og Marsdens resultater viste, at:
* De fleste alfapartikler passerede lige gennem guldfolien. Dette var i overensstemmelse med blommebudding-modellen, da man mente, at den positive ladning var spredt over hele atomet.
* En lille del af alfapartikler blev afbøjet i store vinkler, nogle spredte sig endda tilbage mod kilden. Dette var helt uventet og kunne ikke forklares med blommebudding-modellen.
Disse uventede resultater førte til udviklingen af en ny model af atomet af Ernest Rutherford i 1911. Han foreslog atommodellen , som foreslog at:
* Atomet har en lille, tæt, positivt ladet kerne i centrum. Denne kerne er ansvarlig for det meste af atomets masse.
* Negativt ladede elektroner kredser om kernen på en skylignende måde.
Atommodellen forklarede med succes resultaterne af Geiger og Marsdens eksperiment. De store afbøjninger, der blev observeret, var forårsaget af, at alfapartiklerne kolliderede med den positivt ladede kerne, mens størstedelen af partiklerne gik igennem, fordi atomet for det meste er tomt rum.
Derfor atomets nukleare model understøttes af Geiger og Marsdens resultater.