Gysis vigtigste værk var hans bog, _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908), hvori han beskrev sine studier af anatomien og funktionen af det temporomandibulære led. Han udviklede også adskillige instrumenter og teknikker til måling af okklusion og artikulation, herunder Gysi Simplex Articulator .
Gysis arbejde havde en dyb indvirkning på tandplejens udvikling, og han anses for at være en af fædre til moderne okklusion og artikulation.
Her er en liste over nogle af Alfred Gysis vigtigste værker:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897)
* _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908)
* _The problem of articulation_ (1910)
* _En lærebog i protetisk tandpleje_ (1915)
* _Undersøgelser om mandibularleddet_ (1929)
* _Der Kauapparat des Menschen_ (1940)
Gysis arbejde er blevet oversat til mange sprog, og han har modtaget adskillige priser og hædersbevisninger for sine bidrag til tandplejen. Han anses for at være en af de vigtigste skikkelser i tandplejens historie.