Romanen er skrevet ud fra Brunos perspektiv, en ni-årig tysk dreng, der ikke er klar over den sande natur af sin fars arbejde og de grusomheder, der blev begået i koncentrationslejren ved siden af deres hjem. Gennem Brunos øjne er læserne vidne til den skarpe kontrast mellem det privilegerede liv, han fører, og de barske realiteter, som Shmuel og andre lejrfanger står over for.
Boynes skildring af karaktererne understreger krigens destruktive virkninger og fordomme på både individer og samfund. Brunos transformation fra et naivt barn til en, der begynder at stille spørgsmålstegn ved verden omkring ham, fremhæver vigtigheden af uddannelse og empati i kampen mod had og intolerance. Venskabet mellem Bruno og Shmuel, på trods af de barrierer, som deres omstændigheder pålægger, tjener som et stærkt symbol på den menneskelige ånds modstandskraft, selv i lyset af ufattelig lidelse.
Ydermere tillader Boynes brug af et simpelt sprog og ligefrem historiefortælling, at begivenhedernes alvor får dyb genklang hos læsere, både unge og gamle. Ved at præsentere Holocausts rædsler gennem et barns perspektiv, formidler han den dybe virkning af disse begivenheder uden at ty til grafiske beskrivelser. Denne tilgang understreger det universelle budskab om, at krig og intolerance er ødelæggende kræfter, der skal modarbejdes og elimineres.
Samlet set tjener "Drengen i den stribede pyjamas" som en gribende påmindelse om konsekvenserne af ukontrollerede fordomme og had, og den taler stærkt for fred, tolerance og forståelse blandt mennesker med forskellige baggrunde.