* Farerne ved ukontrolleret kraft og teknologi: Skurken, Mr. Grin, bruger teknologi til onde formål og fremhæver potentialet for misbrug af kraftfulde værktøjer.
* Vigtigheden af at stå op for det rigtige: Alex Rider, hovedpersonen, står over for fare og svære valg, men vælger i sidste ende at kæmpe mod uretfærdighed.
* Venskabs og loyalitets kraft: Alex' venner, især hans onkel Ian, giver støtte og vejledning, hvilket viser vigtigheden af stærke relationer for at overvinde modgang.
* Konsekvenserne af hemmeligholdelse og bedrag: Regeringens involvering i Stormbreaker-projektet og bedraget omkring det fremhæver farerne ved at holde på hemmeligheder og behovet for gennemsigtighed.
Moralen i historien er dog ikke eksplicit angivet, men snarere underforstået gennem karakterernes handlinger og valg. Det understreger vigtigheden af integritet, mod og ansvar i en verden, hvor teknologi og magt let kan misbruges.
I sidste ende opfordrer "Stormbreaker" læserne til at tænke kritisk om verden omkring dem, stille spørgsmålstegn ved autoritet og stå op for, hvad de mener er rigtigt.