Der er noget, der tyder på, at kejsersnit kan være blevet udført i oldtiden. For eksempel skrev den antikke græske læge Hippokrates om en procedure kaldet "embryotomi", som involverede at skære livmoderen op for at fjerne en baby. Det er dog ikke klart, om embryotomi nogensinde faktisk blev udført, og det er muligt, at Hippokrates blot spekulerede.
Det første dokumenterede tilfælde af et vellykket kejsersnit blev udført i 1500 af en schweizisk læge ved navn Jacob Nufer. Nufers patient var en kvinde ved navn Elisabeth Strüb, som led af en tilstand, der kaldes uterusruptur. Nufer fjernede med succes barnet fra Strübs mave, og både mor og barn overlevede.
I århundrederne efter Nufers tid er kejsersnit blevet mere og mere almindeligt. I dag udføres kejsersnit på omkring 30 % af alle fødsler i USA.