Forstærkere:Disse er DNA-sekvenser, der binder transkriptionsfaktorer og fremmer transkriptionen af nærliggende gener. For eksempel er forstærkeren i immunoglobulin tung-kæde locus ansvarlig for det høje niveau af ekspression af disse gener i B-celler.
Promotorer:Disse er DNA-sekvenser, der binder RNA-polymerase og initierer transskriptionen af gener. For eksempel er promotoren i det humane væksthormongen ansvarlig for ekspressionen af dette gen i hypofysen.
Lyddæmpere:Disse er DNA-sekvenser, der binder transkriptionsfaktorer og undertrykker transkriptionen af nærliggende gener. For eksempel er lyddæmperen i det humane β-globingen ansvarlig for undertrykkelsen af dette gen i ikke-erythroide celler.
Transagerende sekvenser:
Transkriptionsfaktorer:Disse er proteiner, der binder til cis-virkende sekvenser og regulerer transskriptionen af gener. For eksempel binder transkriptionsfaktoren Oct-1 til octamer-motivet i immunoglobulin-tungkædeforstærkeren og fremmer transkriptionen af disse gener i B-celler.
RNA-polymerase:Dette er et proteinkompleks, der binder til promotorer og transskriberer gener til RNA.
Andre regulatoriske proteiner:Dette er proteiner, der binder til cis-virkende sekvenser og regulerer transskriptionen af gener på forskellige måder. For eksempel binder proteinet CTCF til CCCTC-motivet i det humane β-globingen og hjælper med at organisere kromatinstrukturen i denne region, som er nødvendig for undertrykkelsen af genet i ikke-erythroide celler.