Gennem fortællingen møder Dante forskellige udfordringer og forhindringer, der symboliserer menneskelige kampe, synder og dyder. Da han daler ned i helvedes dyb, er han vidne til straffen af sjæle, der har begået forskellige overtrædelser, fra de begærlige og frådende til de svigagtige og forræderiske. Disse møder konfronterer Dante med moralske dilemmaer og tvinger ham til at reflektere over sine egne handlinger og fejl.
I skærsilden gennemgår Dante en renselsesproces, mens han bestiger bjerget mod paradis. Her møder han sjæle, der omvender sig for deres synder og stræber efter forløsning. Dette rige afspejler Dantes ønske om åndelig vækst og transformation, når han søger at overvinde sine menneskelige svagheder og stige mod guddommelig nåde.
I sidste ende når konflikten sit klimaks i Paradiset, hvor Dante møder den salige vision og oplever Guds direkte nærvær og guddommelig oplysning. Det symboliserer løsningen af hans konflikt og transcendensen af verdslige kampe og begrænsninger.
I en bredere skala beskæftiger den guddommelige komedie sig også med teologiske og filosofiske spørgsmål relateret til guddommelig retfærdighed, forløsning, fri vilje og syndens og dydens natur. Disse konflikter afspejler Dantes egen udforskning af menneskets natur, moral og det komplekse forhold mellem menneskeheden og det guddommelige.