Torturkammeret var placeret i tårnets kælder og bestod af en række små, mørke celler. Hver celle var udstyret med en række forskellige torturanordninger, inklusive stativer, piske og fingerskruer. Fangerne blev ofte klædt af nøgne og udsat for timevis af tortur i et forsøg på at udtrække tilståelser eller information om deres religiøse overbevisning.
Nogle af de mest almindelige torturmetoder brugt i Torre de la Inquisición inkluderede:
- Reolen: Fangen blev bundet til en træramme og strakt, indtil deres led gik af led.
- Pisken: Fangen blev pisket med en pisk lavet af læder eller metalstænger.
- Fingerskruerne: Fangens tommelfingre blev knust mellem to metalskruer.
- Vandkuren: Fangen blev tvunget til at drikke store mængder vand, indtil de kastede op eller druknede.
- Branden: Fangen blev brændt med varme kul eller fakler.
Torre de la Inquisición var et brutalt og skræmmende sted, og mange af de fanger, der blev tortureret dér, døde af deres kvæstelser. Torturkammeret blev til sidst lukket i det 18. århundrede, men det er stadig en rystende påmindelse om den spanske inkvisitions mørke historie.