Mens Henry Hudson får kredit for at være den første europæer, der udforskede floden i 1609, havde floden allerede et navn, der blev givet af de indfødte amerikanere, der boede i området.
Navnet "Hudson" blev givet til floden af hollandske opdagelsesrejsende der fulgte Hudsons sti. De kaldte det "de rivier van de Heiligen" (floden af de hellige) og "de Noordt Rivier" (North River), men navnet "Hudson" blev til sidst det officielle navn på engelsk.
Så selvom Henry Hudson er en betydelig figur i flodens historie, navngav han det ikke.