Sangen begynder med en spøgende melodi og en gentagen bøn:"Når du ikke er der, føler jeg mig alene." Dette sætter tonen for sangens udforskning af længslen efter et større nærvær i øjeblikke af isolation og svaghed.
Gennem versene reflekterer sangeren over de udfordringer og prøvelser, de gennemgår. De føler sig overvældet af deres omstændigheder og stiller spørgsmålstegn ved, om de har styrken til at fortsætte. De anerkender deres afhængighed af noget eller nogen, der er større end dem selv, og udtrykker deres behov for vejledning, støtte og udfrielse.
Omkvædet fungerer som et vendepunkt i sangen. Den proklamerer:"Når du kommer, er alt i orden." Denne kraftfulde erklæring afspejler et skift i perspektiv, da sangeren finder håb og trøst midt i deres kampe. Sangen antyder, at tilstedeværelsen af en højere magt, et guddommeligt væsen eller en kilde til styrke kan bringe tryghed og fred selv i de mørkeste øjeblikke.
I broen anerkender sangerinden den usikkerhed og smerte, de står over for, men de bekræfter deres tro og tillid. Sangen slutter med et crescendo af følelser, da sangeren erklærer:"Når du kommer, ved jeg, at jeg kan klare det."
Overordnet set er "When You" af Skillet en sang, der taler til den menneskelige oplevelse af at søge styrke, trøst og modstandskraft i tider med modgang. Den fremhæver troens forvandlende kraft og troen på et større nærvær, der kan give håb og sikkerhed i lyset af livets udfordringer.