Sangen begynder med, at Gerard synger om sin mors styrke og modstandsdygtighed og beskriver, hvordan hun opfostrede ham og hans bror Mikey på egen hånd efter deres forældres skilsmisse. Han takker hende for hendes ubetingede kærlighed og støtte og for at lære ham at være stærk og selvstændig.
Som sangen skrider frem, åbner Gerard op om sine følelser af sorg og tab efter sin mors bortgang. Han synger om, hvor meget han savner hende, og hvordan han ville ønske, at han kunne have brugt mere tid sammen med hende. Han udtrykker også sin skyld over ikke at kunne redde hende fra hendes sygdom.
På trods af smerten og sorgen fejrer sangen i sidste ende Donna Lee Ways liv og kærlighed. Gerard synger om, hvordan hun altid vil være i hans hjerte, og hvordan hendes ånd vil fortsætte med at guide ham gennem hans liv.
Musikvideoen til "Mama" indeholder hjemmevideoer og fotografier af Gerard og Mikey med deres mor, samt optagelser fra deres barndom. Det giver en visuel fremstilling af det tætte bånd mellem Gerard og Donna, og det er med til at bringe sangens tekster til live.
Samlet set er "Mama" en kraftfuld og følelsesladet sang, der udtrykker den dybe kærlighed og beundring, som Gerard Way havde for sin mor. Det er en sang om sorg, tab og kærlighedens vedvarende kraft.