- Klassisk musik :Fagotten er et fremtrædende instrument i klassisk musik, hvor den ofte bruges til at spille bas. Det er ofte med i orkesterværker, kammermusik og solostykker.
- Jazz :Fagotten bruges nogle gange i jazzmusik, især i big bands. Det bruges ofte til at spille den gående baslinje, som danner det rytmiske fundament for bandet.
- Folkemusik :Fagotten bruges lejlighedsvis i folkemusik, især i traditionel europæisk folkemusik. Det bruges ofte til at give en dyb, drønende lyd.
- Verdensmusik :Fagotten bruges i en række af verdensmusikgenrer, såsom afrikansk, asiatisk og latinamerikansk musik. Det bruges ofte til at give en lav, resonanslyd, der understøtter de andre instrumenter.
- Elektronisk musik :Fagotten kan også bruges i elektronisk musik, hvor den kan bearbejdes og manipuleres for at skabe en række unikke lyde.