• Brandenburg-koncert nr. 2 i F-dur, BWV 1047:Denne koncert har en fremtrædende fløjterolle i første og tredje sats.
• Brandenburgerkoncert nr. 4 i G-dur, BWV 1049:Fløjten spiller en solorolle i anden sats af denne koncert.
• Orkestersuite nr. 2 i h-mol, BWV 1067:fløjten er med i "Badinerie"-satsen i denne suite.
• Sonate for fløjte i A-dur, BWV 1032:Denne sonate er specielt skrevet til fløjte og cembalo eller continuo.
• Sonate for fløjte og kontinuo i e-mol, BWV 1034:Endnu en sonate med fløjten, akkompagneret af en continuo.
• Partita for fløjte i a-mol, BWV 1013:Denne partita består af flere dansesatser skrevet for fløjten.
• Kantater:Bach inkluderede også fløjtepartier i nogle af sine kirkekantater, såsom "Jauchzet Gott in allen Landen," BWV 51, og "Ich armer Mensch, ich Sündenknecht," BWV 55.
Dette er blot nogle få eksempler på Bachs kompositioner, der inkluderer musik skrevet for fløjter. Bach skrev ikke en eksklusiv fløjtekoncert i sig selv.