Sangens tekster trækker på billeder relateret til videnskab og eksperimenter. Hovedpersonen i sangen er afbildet som en "videnskabsmand", der udfører eksperimenter og foretager observationer i et forsøg på at forstå verden omkring dem. De overvejer spørgsmål om eksistensens natur, livets oprindelse og universets formål.
Gennem hele sangen understreger Coldplay vigtigheden af vedholdenhed og robusthed i jagten på viden. Teksterne antyder, at selv når man står over for tilbageslag og fiaskoer, er det afgørende at fortsætte med at søge efter svar og aldrig miste målet om at forstå universet af syne.
"Scientist" udtrykker også en følelse af undren og ærefrygt over skønheden og kompleksiteten i den naturlige verden. Hovedpersonen undrer sig over universets vidde, de indviklede detaljer i livet og de mysterier, der forbliver uløste. Sangen opfordrer lyttere til at værdsætte verdens vidundere og til at finde inspiration i jagten på videnskabelig viden.
I bund og grund hylder "Scientist" af Coldplay det menneskelige ønske om forståelse og opmuntrer os til at udforske verden med en følelse af nysgerrighed og undren. Det tjener som en påmindelse om vigtigheden af videnskab og stræben efter viden i at forme vores forståelse af universet og vores plads i det.