Museer og institutioner:
* The Wellcome Collection, London: Dette museum rummer en samling af Flemings personlige ejendele, herunder hans laboratorie-notesbog, hvor han dokumenterede sin opdagelse af penicillin.
* The National Portrait Gallery, London: Indeholder et portræt af Alexander Fleming.
* The Science Museum, London: Indeholder forskellige udstillinger relateret til medicinens historie, herunder Flemings arbejde med penicillin.
* The National Museum of Scotland, Edinburgh: Har et afsnit dedikeret til medicinens historie, der viser virkningen af penicillin.
* Universitetet i London: Hvor Fleming studerede og senere blev professor, huser forskellige mindesmærker og artefakter relateret til hans liv og arbejde.
Andre steder:
* The Fleming Memorial Garden, St. Mary's Hospital, London: En lille have dedikeret til Fleming, hvor han arbejdede, da han opdagede penicillin.
* Alexander Fleming House, London: En bygning opkaldt efter Fleming, der huser London School of Hygiene and Tropical Medicine.
* Alexander Fleming Institute, Grækenland: Et forskningsinstitut med fokus på medicinsk forskning.
* Alexander Fleming Laboratory, Rumænien: Et forskningsinstitut dedikeret til mikrobiologi og infektionssygdomme.
* Forskellige hospitaler, skoler og forskningsinstitutter rundt om i verden: Bær hans navn som en anerkendelse af hans bidrag til medicin.
Selvom der måske ikke er et enestående museum dedikeret til Alexander Fleming, bliver hans betydelige bidrag til medicin anerkendt og fejret i disse forskellige institutioner og mindesmærker over hele kloden.