Godt vs. Ondt: Romanen udforsker det klassiske tema om det gode mod det onde, repræsenteret af Sherlock Holmes and the Hound. Holmes legemliggør fornuftens og deduktionens magt, mens hunden symboliserer mørkets og overtroens kræfter.
Den menneskelige tilstand: Romanen dykker også ned i den menneskelige tilstand, især temaerne frygt, skyld og forløsning. Sir Henry Baskerville er hjemsøgt af sin families forbandelse, mens Dr. Mortimer kæmper med skyldfølelse over Sir Charles Baskervilles død. Holmes repræsenterer imidlertid det menneskelige intellekts triumf over overtro og frygt.