Der er en scene, hvor han er anholdt af GUN (Guardian Units of Nations), men han bliver senere løsladt efter at have bevist sin uskyld og hjulpet med at stoppe skurken, Shadow.
Det er vigtigt at bemærke, at konceptet "fængsel" for en karakter som Sonic, der er superhurtig og i stand til at trodse tyngdekraften, ikke rigtig giver mening inden for konteksten af Sonic-universet.