Nogle af de vigtigste forskelle mellem manga og anime inkluderer:
* Rækkefølgen af begivenheder er forskellig. I mangaen sker nogle begivenheder tidligere eller senere, end de gør i anime. For eksempel i mangaen møder Teito Klein Frau i det første kapitel, mens de i animeen ikke mødes før episode 8.
* Nogle tegn er forskellige. I mangaen er der nogle karakterer, der ikke optræder i anime, og nogle karakterer, der optræder i anime, optræder ikke i manga. For eksempel optræder karakteren af Ceres ikke i mangaen, mens karakteren af Mikage ikke optræder i anime.
* Afslutningen er anderledes. Manga og anime har forskellige slutninger. I mangaen slutter Teito Klein og Fraus rejse anderledes, end den gør i animeen.
Samlet set er 07-Ghost manga og anime to forskellige og separate fortolkninger af den samme historie. Selvom de deler nogle ligheder, er der også mange forskelle mellem de to versioner.