Albus og Scorpius opdager en mystisk tidsvender og bruger den til at rejse tilbage i tiden, uforvarende ændre fortiden og skabe en alternativ tidslinje, hvor Voldemort ikke er blevet besejret, og ondskaben forbliver. Albus og Scorpius må kæmpe mod tiden for at genoprette den oprindelige tidslinje og rette tingene op, alt imens de kæmper med deres egne personlige kampe og vægten af deres families arv.
Under hele rejsen begiver Albus og Scorpius sig ud på forskellige tidsrejseeventyr, møder velkendte karakterer fra den originale Potter-serie og afslører dybe hemmeligheder og afsløringer om deres fortid og identitet. Mens de stræber efter at reparere den skade, de har forårsaget, lærer de den sande betydning af venskab, mod og at se fortiden i øjnene for at forme en bedre fremtid.