Du vil ikke være i stand til at komme ind i Hall of Fame, og du vil ikke være i stand til at fange flere legendariske Pokémon.
Derudover vil du ikke være i stand til at få adgang til nogen af de områder, der er låst op ved at besejre de tre legendariske fugle.
Hvis du har dræbt de tre legendariske fugle, skal du genstarte dit spil for at fortsætte med at spille.