Her er, hvad der sker, når du fuldfører Silph Co. Building i disse spil:
* Du redder den kidnappede Pokemon: Lederen af Team Rocket, Giovanni, har kidnappet Pokemon og bruger dem til sine egne onde planer. Du skal kæmpe dig vej gennem bygningen for at redde dem.
* Du besejrer Giovanni: Du vil til sidst møde Giovanni i en udfordrende kamp. Hvis du vinder, vil du befri bygningen og få en speciel genstand (Silph Scope), som hjælper dig med at håndtere Ghost-type Pokémon.
* Du bidrager til historien: At færdiggøre Silph Co. Building er en nøglebegivenhed, der hjælper dig med at komme videre i historien og afdække flere af Team Rockets planer.
I Pokemon Gold og Silver er "Silph Co. Building" fraværende . Der er helt andre steder og en anden historie med et nyt skurkhold, Team Rocket.