1. Saml de syv Chaos Emeralds: Disse er spredt ud over spillets niveauer, og du har brug for dem alle for at nå den sidste kamp.
2. Ansigt mod Dark Gaia i slutningen af spillet: Efter at have samlet alle syv Chaos Emeralds, vil du møde Dark Gaia i sin sande form, et massivt, flerhovedet udyr.
3. Brug Chaos Emeralds' kraft: Du vil bruge den kombinerede kraft fra Emeralds til at rense Dark Gaia. Dette involverer at bruge "Super Sonic"-formen, som låses op ved at samle alle syv Chaos Emeralds.
4. Udfør oprensningen: Mens du er i Super Sonic-form, vil du udløse et kraftfuldt angreb på Dark Gaia. Dette angreb dræber ikke Dark Gaia, men renser den i stedet, genopretter balancen i verden og bringer den tilbage til sin oprindelige form.
Spillets historie fokuserer på ideen om gendannelse i stedet for direkte drab. Dark Gaia, selvom den er destruktiv, er i sidste ende en del af verdens balance, og målet er at bringe den tilbage til sin retmæssige plads.