* Individuelle styrker og svagheder: Forskellige Pokémons har forskellige statistikker, bevægelser og evner, hvilket gør dem bedre i forskellige scenarier.
* Uddannelse og niveauer: En veltrænet og højt niveau Pokémon vil altid være stærkere end en lavt niveau, uanset dens art.
* Spillers strategi og færdigheder: Hvordan en spiller bruger deres Pokémon i kamp, kan i høj grad påvirke deres effektivitet.
Nogle Pokémon anses dog ofte for at være meget magtfulde i Pokémon Crystal på grund af deres stærke statistikker og movepools:
* Mewtwo: Mewtwo er uden tvivl den mest kraftfulde Pokémon i hele franchisen, og er en Psychic-type med utrolige statistikker og adgang til kraftfulde træk som Psychic og Psybeam.
* Tyranitar: Tyranitar er en pseudo-legendarisk Pokémon med et enormt angreb og forsvar, en kraft, man skal regne med i kampe.
* Gyarados: Med sit karakteristiske Dragon Dance-træk kan Gyarados blive utrolig kraftfuld og feje hele hold.
* Dragonite: En anden Pseudo-legendarisk Pokémon, Dragonite er en kraftfuld flyvende/drage-type med en fantastisk movepool.
* Alakazam: Alakazam er en psykisk type med utroligt specialangreb, og kan være utrolig kraftfuldt, når det bruges effektivt.
* Snorlaks: Selvom det er langsomt, har Snorlax en utrolig mængde HP og forsvar, hvilket gør det svært at tage ned.
I sidste ende afhænger den "mest kraftfulde" Pokémon i Crystal af individuelle præferencer, spillestil og de specifikke udfordringer, du står over for.