Mewtwo er en Psychic-type Pokémon, hvilket betyder, at den er svag til følgende typer:
* Bug
* Spøgelse
* Mørk
Disse typer vil være supereffektive skade mod Mewtwo.
Husk på, at Mewtwo også kan lære bevægelser af andre typer, så den kan være modstandsdygtig over for nogle af disse angreb afhængigt af dens bevægelsessæt.