Tidlig karriere:
* Breaking the Waves (1996): Hendes breakout-rolle gav hende en Oscar-nominering for bedste kvindelige hovedrolle.
* Hilary og Jackie (1998): Portrætteret den geniale, men urolige violinist, Jacqueline du Pré.
* Bokseren (1997): Et romantisk drama, der foregår i Nordirland.
* Angela's Ashes (1999): Spillede moderen i denne tilpasning af Frank McCourts erindringer.
Senere karriere:
* Red Dragon (2002): En thriller baseret på romanen af Thomas Harris.
* Peter Sellers liv og død (2004): Spillede Peter Sellers kone.
* The War of the Worlds (2005): En science fiction-film med Tom Cruise i hovedrollen.
* Pigen i caféen (2005): Et politisk drama, der foregår i Bruxelles.
* Biernes hemmelige liv (2008): Et drama om en ung pige, der stikker af for at finde sin mor.
* Bogtyven (2013): Et historisk drama om en ung pige i Nazityskland.
* Everest (2015): Spillede rollen som Helen Wilton.
* The Lighthouse (2019): En psykologisk gyserfilm med Willem Dafoe.
* The Electrical Life of Louis Wain (2021): Spillede rollen som Emily Richardson.
* Kongens mand (2021): En prequel til Kingsman-filmserien.
Andre bemærkelsesværdige film:
* The Escapist (2008): Et krimidrama.
* Anna Karenina (2012): En filmatisering af Leo Tolstojs roman.
* Min uge med Marilyn (2011): Et biografisk drama om Marilyn Monroe.
* The Lost Daughter (2021): Et psykologisk drama med Olivia Colman i hovedrollen.
Dette er blot et udpluk af Emily Watsons imponerende filmografi. Hun fortsætter med at være en aktiv og anerkendt skuespillerinde med mange flere projekter under hendes bælte.