Filmen fortæller historien om to bedste venner, Rafe og Danny, som begge er piloter i den amerikanske flåde. Rafe er forelsket i en sygeplejerske ved navn Evelyn, som også er Dannys kæreste. Filmen udforsker temaer om kærlighed, venskab og patriotisme i sammenhæng med de ødelæggende begivenheder i Pearl Harbor og den efterfølgende krig.
Filmen fremhæver det amerikanske folks ofre under krigen og vigtigheden af enhed og modstandskraft i krisetider.