Film:
* Pink Flamingos (1972): Waters spillede rollen som "The Divine" i denne klassiske kultfilm.
* Desperate Living (1977): Han optrådte også som "The Divine" i denne film.
* Polyester (1981): Waters spillede rollen som "The Divine" og instruerede også denne film.
* Hårspray (1988): Waters havde en rollefigur som pladeforhandler i denne film.
* Cry-Baby (1990): Han optrådte kort som skoleleder.
* Serial Mom (1994): Waters spillede rollen som "The Divine" i denne film.
* Pecker (1998): Han optrådte som "The Divine" igen i denne film.
* A Dirty Shame (2004): Waters spillede rollen som "The Divine" i denne film.
* This Filthy World (2006): Han optrådte i denne dokumentar om sit liv og arbejde.
* Fruitvale Station (2013): Waters optrådte som nyhedsreporter.
* The House That Jack Built (2018): Waters spillede en lille rolle i denne film af Lars von Trier.
Fjernsyn:
* The Simpsons (1991): Waters gav udtryk for sig selv i episoden "Homer Defined".
* South Park (1997): Han gav også udtryk for sig selv i episoden "Chef Aid".
* The Sopranos (2001): Waters havde en cameo som filminstruktør i afsnittet "The Blue Comet".
* Arrested Development (2003): Han havde en lille rolle i episoden "The Immaculate Election."
* The Larry Sanders Show (1992-1998): Waters optrådte et par gange som ham selv i dette show.
* Ugly Betty (2006-2010): Han optrådte som sig selv i episoden "Ugly Betty's World."
* RuPaul's Drag Race (2010-i dag): Waters har optrådt adskillige som gæstedommer i dette show.
Mens hans optrædener i andre projekter er begrænsede, er John Waters mest berømt for sine egne unikke og indflydelsesrige film.