Film:
* Braveheart (1995) - som "Morris"
* The Boondock Saints (1999) - som "Murphy MacManus"
* Snatch (2000) - som "Brick Top"
* Gladiator (2000) - som "Cicero"
* The Boondock Saints II:All Saints Day (2009) - som "Murphy MacManus"
* Smokin' Aces (2006) - som "Darius"
* The Last Stand (2013) - som "Burnett"
* Guardians of the Galaxy (2014) - som "Fin Fang Foom" (stemme)
* Sons of Anarchy (2014) - som "Filip "Chibs" Telford" (krediteret som "Tommy Flanagan")
* Iceman (2014) - som "Professoren"
* Det sidste ansigt (2016) - som "Jack"
* The Big Lebowski (1998) - som "Ultraman" (ukrediteret)
* The Jacket (2005) - som "Don" (ukrediteret)
* De tre musketerer (2011) - som "Rochefort" (ukrediteret)
Fjernsyn:
* Sons of Anarchy (2008-2014) - som "Filip "Chibs" Telford"
* The Shield (2004-2008) - som "Tommy"
* The Americans (2013) - som "Arkady Ivanov"
* American Gods (2017-2021) - som "The Technical Boy"
* Mayans M.C. (2018-nu) - som "Filip "Chibs" Telford"
* Westworld (2016-nutid) - som "Martin Connells"
* The Expanse (2015-2022) - som "Camina-trommeslager"
* "Twilight Zone" (2019) - som "Manden"
* "The Witcher" (2023) - som "Martin"
Dette er ikke en udtømmende liste, men den inkluderer nogle af hans mest bemærkelsesværdige roller. Han har også haft roller i andre tv-shows og film, både store og uafhængige.
Tommy Flanagan er en respekteret skuespiller kendt for sin stærke og ofte truende tilstedeværelse på skærmen.