* Legion d'honneur (Æreslegionen) , den højeste franske fortjeneste, blev tildelt ham i 1878 og 1881.
* Copley-medaljen (1874) , en af de ældste og mest prestigefyldte videnskabelige priser fra Royal Society of London.
* Albert-medaljen (1882) , uddelt af Royal Society of Arts som en anerkendelse af hans enestående bidrag til videnskab og teknologi.
* Han blev også valgt til flere prestigefyldte akademier , herunder det franske videnskabsakademi, Royal Society of London og Académie Française.
Dette er blot nogle få af de mange priser og hæder, som Louis Pasteur modtog gennem hele sin karriere. Han betragtes bredt som en af de vigtigste videnskabsmænd gennem tiderne, og hans arbejde har haft en dyb indvirkning på menneskers sundhed og velvære.