- "Hvorfor korset?" (1901) :
Dette er hans mest kendte værk, som præsenterer den teologiske begrundelse for Jesu Kristi korsfæstelse, og hvordan den betegner Guds kærlighed og nåde.
- "The Battleground of the Soul:A Study in the Science of Sanctification" (1903) :
Denne bog udforsker den kristnes åndelige rejse, og hvordan troende bør stræbe efter personlig hellighed og sejr i deres indre kampe.
- "Hemmeligheden bag en glad dag" (1904) :
Denne bog har til formål at inspirere individer til at finde lykke og tilfredshed ved at komme tættere på Gud og omfavne et liv i åndelig transformation.
- "Livet der vinder" (1906) :
Dette arbejde fremhæver vigtigheden af at have et vital og sejrrigt kristent liv, idet det understreger behovet for stærk tro og konsekvent overgivelse til Guds vilje.
- "Kongerigets nøgle" (1907) :
I denne bog redegør Johnstone for Jesu Kristi lære og understreger betydningen af personligt discipelskab og at leve i overensstemmelse med Guds befalinger.
- "Den sikre vej til frelse" (1909) :
Dette værk giver en ligetil og kortfattet forklaring på, hvordan individer kan opnå frelse gennem tro på Jesus Kristus.
- "Guds storhed" (1919) :
Denne bog dykker ned i Guds majestæt og suverænitet og fokuserer på hans egenskaber og hvordan de påvirker menneskelig forståelse og tilbedelse.
- "Korset og dets betydning" (1930) :
Johnstone vender tilbage til betydningen af Kristi korsfæstelse og belyser dens mangefacetterede implikationer for menneskelig frelse og forsoning med Gud.
Dette er nogle af de fremtrædende skrifter af John Chalmers Johnstone, der demonstrerer hans teologiske dybde og den åndelige indvirkning, han havde på adskillige læsere gennem årene.